在冻干机开始抽真空之前，即在干燥过程开始之前，应彻底冷冻好产品原料。如果不这样子，在抽真空时，就可能出现膨胀，溢出容器外面来。

在一些简单的冻干机设备重，首先就应该把需要真空干燥的原料，以容器为单位进行冷冻，然后再转移到干燥设备中。

我们说明一下，冷冻可以使用标准制冷设备，或是冷池，或是液氮。

在冻干机利用冷冻板进行冷冻时，可以将待冷冻的原料直接冷冻到板上，可以把产品注入小瓶，或散装在盘类容器中。利用冷冻板，可以对冷冻率进行监控。

冻干机冷冻率决定了产品的冻结速率，从而决定了该批的均质性和冰晶的大小，通常缓慢的冻结率对于提高均质性有重要的意义。结晶的时间越长，结成的冰晶体积也就越大，较大的冰晶可以快速进行干燥，可以快速排出水蒸气。

但是，在生物工程技术中，对冻干工艺提出了特殊的要求，也就是冰晶大小的范围允许偏差，比如不允许有能够破坏细胞核的冰晶。因此对这类产品，应注意不能形成大颗粒的冰晶。